邳州博物馆现有各类馆藏文物5000余件。为妥善保护好这些文物，发挥文物的作用，早在1988年邳州市就投资100。随着邳州经济社会事业的迅速发展，位于老城区的博物馆难以满足文物保存和陈列展出的需要，同时落后陈旧的安全、消防设施也不利于文物的保护。为了大力弘扬民族文化，提升城市品位，邳州市委、市政府于2003年9月，投入3000余万元新建了一座博物馆，2005年11月18日建成开馆。新馆陈列分为古邳文明、长河余音、民俗文化三部分，展厅面积3000平方米，展出文物500余件，其中以大墩子彩陶、春秋战国青铜器、邳州汉画像石、汉代虎形石镇、西周铜矛、被誉为“全国象牙化石之王”的大象门齿化石而闻名于世。新馆现代化安防设施齐全，办公室、会议厅、学术报告厅、礼品服务部、贵宾休息室等功能设施配置合理，另外还有一个符合标准的现代化文物库房，面积520平方米。